มูลนิธิสิกขาเอเซีย  ถือกำเนิดขึ้นโดยองค์กร JSRC (Japan Sotoshu Relift Committee) ที่เข้ามามีบทบาทในการช่วยเหลือทางด้านวัฒนธรรม พร้อมกับการสอนพระพุทธศาสนาให้กับผู้อพยพตามแนวตะเข็บชายแดน ไทย-กัมพูชา จนกระทั่งผู้อพยพมีความเป็นอยู่อย่างสงบสุข และปลอดภัยตามอัตภาพ ต่อมาองค์กร (JSRC) ได้ขยายขอบข่ายการทำงานมายังชนกลุ่มน้อยตามชนบทที่ห่างไกล รวมถึงชุมชนแออัดต่างๆ ในกรุงเทพฯ และในต่างจังหวัด เพื่อมุ่งหวังที่จะให้ประชาชนและเยาวชน โดยเฉพาะอย่างยิ่งเด็กผู้ด้อยโอกาสได้มีอนาคต ทางการศึกษาและมีความเป็นอยู่ที่ดีขึ้นและนับจากปี 2534 เป็นต้นมา องค์กร JSRC ได้ทำการจดทะเบียนจัดตั้งเป็นมูลนิธิขึ้น โดยใช้ชื่อว่า "มูลนิธิสิกขาเอเชีย" Sikkha Asia Foundation  สถานที่ 100/14-20 ซอยเคหะคลองเตย 4 แขวงคลองเตย เขตคลองเตย กทม.